Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm14579-201ENSMUST00000117068 283 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm26005-201ENSMUST00000158802 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Vpreb1P13372 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Hmga1b-202ENSMUST00000178955 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm19257-201ENSMUST00000186121 183 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm38311-201ENSMUST00000192945 165 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Vpreb1P13372 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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