Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm12025-201ENSMUST00000117768 144 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm42585-201ENSMUST00000198731 4020 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr719-ps-201ENSMUST00000137795 252 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Zfp273-203ENSMUST00000181391 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms