Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm22308-201ENSMUST00000177609 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC074315.1-201ENSMUST00000228801 214 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm25833-201ENSMUST00000104137 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29512-201ENSMUST00000185544 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28110-201ENSMUST00000185782 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29057-201ENSMUST00000186468 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29661-201ENSMUST00000186781 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28737-201ENSMUST00000186808 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29118-201ENSMUST00000186908 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28433-201ENSMUST00000187085 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28759-201ENSMUST00000187621 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28831-201ENSMUST00000187739 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28200-201ENSMUST00000187778 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28752-201ENSMUST00000188340 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29378-201ENSMUST00000188723 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28569-201ENSMUST00000188748 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28120-201ENSMUST00000188812 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28369-201ENSMUST00000188993 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29037-201ENSMUST00000189092 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28909-201ENSMUST00000189406 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28861-201ENSMUST00000189681 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29180-201ENSMUST00000190003 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29575-201ENSMUST00000190597 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm29469-201ENSMUST00000191448 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Cldn34c3J3QJW5 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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