Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Mir466f-1-201ENSMUST00000104779 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
Pdzd2E9Q1M1 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC0.28□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 CT010480.1-201ENSMUST00000223612 363 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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