Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Mir466f-3-201ENSMUST00000104788 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 4930513O06Rik-201ENSMUST00000033625 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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