Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 CT025157.1-201ENSMUST00000226241 292 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm18338-201ENSMUST00000222381 560 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm13860-201ENSMUST00000125185 452 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Col4a3Q9QZS0 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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