Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm7241-201ENSMUST00000159853 357 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Igkv5-45-201ENSMUST00000103366 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm43563-201ENSMUST00000196761 198 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm14015-201ENSMUST00000130634 3949 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
Limd1Q9QXD8 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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