Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25773-201ENSMUST00000116718 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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