Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr1183-203ENSMUST00000219871 8353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Zfp616-201ENSMUST00000074813 5014 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Cdh7-201ENSMUST00000027542 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Atad1-201ENSMUST00000070210 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir6715-201ENSMUST00000184990 57 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Foxp2-203ENSMUST00000115470 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm13630-201ENSMUST00000127849 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Tmc4-ps-201ENSMUST00000117819 258 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm24930-201ENSMUST00000158315 83 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir6537-201ENSMUST00000184150 110 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r38-201ENSMUST00000108554 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.8 ms