Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Gde1Q9JL56 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Igkv8-16-201ENSMUST00000103392 362 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Gde1Q9JL56 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms