Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm6374-201ENSMUST00000159051 788 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r77-203ENSMUST00000227320 8308 ntAPPRIS P2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
RabggtaQ9JHK4 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 CT485608.1-201ENSMUST00000228759 389 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1009-203ENSMUST00000216443 4047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13967-201ENSMUST00000120404 380 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm24914-201ENSMUST00000157285 313 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RabggtaQ9JHK4 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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