Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir30d-201ENSMUST00000083503 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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