Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
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Sgo1Q9CXH7 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Sgo1Q9CXH7 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
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