Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Mir7242-201ENSMUST00000183710 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Prdm5Q9CXE0 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Prdm5Q9CXE0 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Prdm5Q9CXE0 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Prdm5Q9CXE0 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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Prdm5Q9CXE0 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Prdm5Q9CXE0 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Prdm5Q9CXE0 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Prdm5Q9CXE0 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Prdm5Q9CXE0 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Prdm5Q9CXE0 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Prdm5Q9CXE0 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Prdm5Q9CXE0 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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