Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 4930528H21Rik-201ENSMUST00000204264 495 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC159621.1-201ENSMUST00000223249 163 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
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