Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Zfp991-201ENSMUST00000084149 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr901-203ENSMUST00000216644 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm8011-201ENSMUST00000172163 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Sacs-203ENSMUST00000119943 14991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm23451-201ENSMUST00000083328 122 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1104-202ENSMUST00000214857 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
Apobec3Q99J72 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Serpina7-201ENSMUST00000033626 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms