Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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Ccdc71Q8VEG0 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm23803-201ENSMUST00000104610 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Ccdc71Q8VEG0 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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Ccdc71Q8VEG0 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
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