Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm22287-201ENSMUST00000083197 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr1309-205ENSMUST00000216948 5168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22534-201ENSMUST00000158173 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm43115-201ENSMUST00000196244 160 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm7123-201ENSMUST00000117647 213 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25866-201ENSMUST00000158245 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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