Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gpr82-201ENSMUST00000053659 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Usp38Q8BW70 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms