Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NischQ80TM9 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm3298-201ENSMUST00000165289 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Snord32a-201ENSMUST00000083285 83 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm20811-201ENSMUST00000190500 553 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC133176.1-201ENSMUST00000226668 219 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Defa-ps12-201ENSMUST00000122353 193 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC126043.1-201ENSMUST00000221304 1141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 n-R5s50-201ENSMUST00000083168 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC1.15□□□□□ -2.22
NischQ80TM9 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm25332-201ENSMUST00000158038 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
NischQ80TM9 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms