Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25896-201ENSMUST00000083713 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm22800-201ENSMUST00000175627 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Mir214-201ENSMUST00000083582 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm38208-201ENSMUST00000192476 114 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm36638-201ENSMUST00000193295 400 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm19540-201ENSMUST00000221843 810 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm21258-201ENSMUST00000178673 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm20888-201ENSMUST00000178934 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm21650-201ENSMUST00000179073 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm20937-201ENSMUST00000180329 567 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm29051-201ENSMUST00000190184 369 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm14884-201ENSMUST00000120456 196 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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