Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm11512-201ENSMUST00000119669 663 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.6 ms