Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps50-201ENSMUST00000216908 453 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm38113-201ENSMUST00000193704 201 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 4930440C22Rik-201ENSMUST00000185490 1565 ntTSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29389-201ENSMUST00000191562 352 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm14923-201ENSMUST00000118270 155 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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