Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 B230216N24Rik-202ENSMUST00000159353 345 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Nkx6-3Q3UHX8 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms