Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vmn2r50-201ENSMUST00000074943 2586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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