Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm567-201ENSMUST00000197127 469 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm19790-201ENSMUST00000214414 251 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC160550.3-201ENSMUST00000226818 400 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22027-201ENSMUST00000122737 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23350-201ENSMUST00000158429 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm5127-202ENSMUST00000101297 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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ptchd1Q14B62 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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ptchd1Q14B62 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm26476-201ENSMUST00000122618 313 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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ptchd1Q14B62 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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ptchd1Q14B62 Zfp600-204ENSMUST00000168483 4244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Vmn2r19-201ENSMUST00000073948 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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ptchd1Q14B62 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
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ptchd1Q14B62 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm40810-201ENSMUST00000219149 253 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr1309-203ENSMUST00000214935 5448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
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