Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm15692-201ENSMUST00000152173 352 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm15659-201ENSMUST00000118881 341 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AC102291.2-201ENSMUST00000228083 367 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rpusd3Q14AI6 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm18417-201ENSMUST00000176564 648 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 AC111046.1-201ENSMUST00000217715 412 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rpusd3Q14AI6 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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