Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm18486-201ENSMUST00000184040 298 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Smcp-202ENSMUST00000194965 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Zbtb41-201ENSMUST00000039867 8361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr346-202ENSMUST00000213258 4104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm45005-201ENSMUST00000206640 157 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr136-202ENSMUST00000208525 2534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Hoxd1Q01822 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24936-201ENSMUST00000122598 247 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm28932-201ENSMUST00000186300 357 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms