Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Pkp1P97350 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms