Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.15□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm15563-201ENSMUST00000124953 410 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24222-201ENSMUST00000158834 93 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir873a-201ENSMUST00000104863 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms