Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23296-201ENSMUST00000082555 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24859-201ENSMUST00000082729 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm28002-201ENSMUST00000184832 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Dmd-203ENSMUST00000114000 14910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxc11P31313 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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