Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm18747-201ENSMUST00000198129 648 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtprmP28828 3830403N18Rik-201ENSMUST00000033458 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
PtprmP28828 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC154257.2-201ENSMUST00000224166 340 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm45262-201ENSMUST00000209917 1463 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm32250-201ENSMUST00000191885 322 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm43250-201ENSMUST00000196536 273 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Mir208b-201ENSMUST00000104735 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Igkv13-57-2-201ENSMUST00000196590 336 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Cmc4-202ENSMUST00000120286 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.22
PtprmP28828 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm21858-201ENSMUST00000177834 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PtprmP28828 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
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