Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Gm35386-201ENSMUST00000204603 629 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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PdgfraP26618 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PdgfraP26618 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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