Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr681-201ENSMUST00000098157 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm37290-201ENSMUST00000195775 339 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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Nedd9O35177 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Nedd9O35177 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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