Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Rpl31-ps13-201ENSMUST00000060994 378 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr68-202ENSMUST00000216811 4093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Scml1-201ENSMUST00000136860 576 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm13752-201ENSMUST00000138195 491 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23262-201ENSMUST00000158323 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr918-202ENSMUST00000215461 3783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn34c3J3QJW5 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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