Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Dnal1-203ENSMUST00000136159 403 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 n-R5s166-201ENSMUST00000082898 121 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Gm8005F6YKY3 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.2 ms