Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 AL928567.1-201ENSMUST00000197891 138 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Ccdc6D3YZP9 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.6 ms