Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 4930543K20Rik-201ENSMUST00000217044 355 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm27470-201ENSMUST00000184070 210 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rtf1A2AQ19 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rtf1A2AQ19 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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