Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 4930469K13Rik-203ENSMUST00000224226 243 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Cldn8Q9Z260 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms