Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm6796-201ENSMUST00000211919 243 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm10267-201ENSMUST00000091916 258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cln8Q9QUK3 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr851-202ENSMUST00000214130 7123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm26652-202ENSMUST00000181672 475 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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