Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Mir471-201ENSMUST00000093596 67 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm37298-201ENSMUST00000193770 3868 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Csmd3-201ENSMUST00000100670 13022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-226ENSMUST00000191511 3962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm6897-201ENSMUST00000117714 138 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm14758-201ENSMUST00000119104 138 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC122298.1-201ENSMUST00000222574 165 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr609-203ENSMUST00000216360 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Kctd12b-202ENSMUST00000112572 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm10042-201ENSMUST00000079884 78 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm26165-201ENSMUST00000083791 138 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 AC153522.2-201ENSMUST00000218389 3853 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr361-202ENSMUST00000214969 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm12374-201ENSMUST00000147108 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm44343-201ENSMUST00000196702 90 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Rabgef1Q9JM13 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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