Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 AC101984.1-201ENSMUST00000219639 402 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc39Q9D5Y1 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccdc39Q9D5Y1 AC115891.1-201ENSMUST00000215798 1755 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc39Q9D5Y1 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8292-201ENSMUST00000162574 396 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc39Q9D5Y1 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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Ccdc39Q9D5Y1 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7984-201ENSMUST00000060640 538 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Ccdc39Q9D5Y1 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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