Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Ccdc47Q9D024 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25124-201ENSMUST00000083345 164 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Ccdc47Q9D024 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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