Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Mir6335-201ENSMUST00000184081 98 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm31520-201ENSMUST00000203048 733 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm20405-201ENSMUST00000174002 229 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr917-201ENSMUST00000076542 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Rprd1bQ9CSU0 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
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