Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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Atg4aQ8C9S8 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25376-201ENSMUST00000104340 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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Atg4aQ8C9S8 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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Atg4aQ8C9S8 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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Atg4aQ8C9S8 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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Atg4aQ8C9S8 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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Atg4aQ8C9S8 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Atg4aQ8C9S8 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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