Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm12837-201ENSMUST00000120131 373 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm38329-201ENSMUST00000193473 427 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm44301-201ENSMUST00000200362 143 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.46□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm43885-201ENSMUST00000204928 2542 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm16147-201ENSMUST00000162143 373 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm44058-201ENSMUST00000204335 467 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm44828-201ENSMUST00000203745 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22759-201ENSMUST00000102276 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm27610-201ENSMUST00000184026 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NipblQ6KCD5 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
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