Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Mucl2-201ENSMUST00000037685 639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Gm20854Q62461 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm45252-201ENSMUST00000211579 397 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm25557-201ENSMUST00000158084 315 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Gm20854Q62461 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.7 ms