Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Rbbp4Q60972 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Rbbp4Q60972 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
Rbbp4Q60972 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Rbbp4Q60972 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Ranbp2-ps9-201ENSMUST00000184566 382 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm43669-201ENSMUST00000198229 436 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms