Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Olfr196-201ENSMUST00000077027 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Sft2d1Q5SSN7 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm26692-201ENSMUST00000180428 688 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC125464.1-201ENSMUST00000228013 512 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.76□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm15445-201ENSMUST00000146700 603 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Snrpert-201ENSMUST00000121967 279 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm28305-201ENSMUST00000147249 365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Sft2d1Q5SSN7 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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