Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
Trim71Q1PSW8 Olfr800-202ENSMUST00000217094 3831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25466-201ENSMUST00000103995 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm29235-201ENSMUST00000185786 442 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC160984.2-201ENSMUST00000224927 791 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14624-201ENSMUST00000117746 192 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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